造成学生学习困难的原因并不单一，不是一个学生成绩差就可以解答的。即便是困难的症状相同成因也是各不相同的。例如，同样的两个数学差生，一位可能是因轻微神经功能发育问题造成的；另一位可能是情绪情感问题造成的。就是轻微神经功能发育问题造成的也有不同的差异。举例说，一个孩子低级计算错误很多，漏写数、错写数，答案自然就错，这可能和他的注意品质有关；另一个孩子看数学题只注重题目中的数字、局部和细节，不注意题目中提供条件之间的关系，不能地获取题目中的信息，答案自然也错。
对于刚开始读书的孩子来说，根本就不存在不喜欢读书这样的属于价值观方面的问题。一二年级的小孩如果有学习困难并且表现在学习技能缺失上，大部分和生理（神经功能发育、体能状况）有关。
有的孩子因为不能安静地听课，考试成绩很差，老师要求带去医院查多动症；还有的孩子学不会阅读、默不出生字，写汉字老出问题，这些问题都可以归结为“学习障碍症”。
如有的孩子并不一定有学习技能方面的问题，他们更常见的症状是看到难题就回避，作业量一大就放弃，学习效很低，再加上老师、家长不停地指责，情绪也很糟，这在低年级学生中较常见。用“五行”管理的办法来矫治，只要坚持做，干预后的三四年会看到进步的效果，但不能操之过急。
并非出生时有问题的儿童都有学习困难，不过，这一比例非常高。如果出生时没有问题，智力也没有问题，就要看其他生理现象。例如遗尿症、头上白发、出汗少、睡眠障碍、脾胃虚弱等都可能导致体能和精神力量低下。学习需要足够的身体支持，体力和脑力的缺乏自然导致注意力和记忆能力的下降，学习的基本条件差了，学习成绩自然就差了。
